雖然都是湖北省的地級市，但是地區不同，市政府分屬不同的地方。荊門市政府在東寶區，荊州市政府在沙市區。
荊州，古稱“江陵”，是湖北省地級市，長江中遊城市群的重要成員。地處湖北中南部，長江中遊，江漢平原腹地，國土面積1.41.000平方公裏。
湖北省地級市荊門，是長江中遊城市群的重要成員，湖北省中部區域性中心城市。素有“荊楚門戶”之稱，地處湖北省中部，漢江中下遊，北接襄陽、隨州，西接宜昌，東臨孝感，南分別與荊州、潛江、天門接壤。
擴展數據:
1，地點:
荊州位於北緯111 15—114 05，北緯29° 26—31° 37。位於湖北省中南部，江漢平原腹地，長江自西向東橫貫全市，全長483公裏。荊州東與武漢相連，西與宜昌相連，南與湖南常德相連，北與荊門、襄陽相連。總面積1.41，000平方公裏，其中平原湖區占78.7%，丘陵低山區占21.1%。
荊門市位於湖北省中部，北與襄陽市、隨州市接壤，西接宜昌市，東接孝感市，南分別與荊州市、潛江市、天門市接壤。東西最大水平距離1.55km，南北最大垂直距離1.31km，總領土面積1.24萬平方公裏，介於東經和東經之間。
2.地形:
荊州主要位於平原地區，海拔20-50米，相對高度不到20米。丘陵主要分布在王家橋松滋市老城區、荊州區石首市司家場及川店、壩陵、桃花山，海拔100-500米，相對海拔50-100米。低山主要分布在松滋市西南部與湖南省交界處，海拔500米左右。
荊門市東、西、北高，中、南低，向南開闊，山地河谷低，丘陵溝壑，平原湖泊。東北部鐘祥、京山大部分地區位於大紅山南麓，地質特征為褶皺斷塊山地，主要由古生代、中生代碳酸鹽巖、碎屑巖和元古代變質巖組成，形成低山或丘陵。
3.水文:
荊州城內河流縱橫交錯，湖泊密布。全市河流近百條，均屬長江水系，主要包括長江幹流及其支流松滋河、湖渡河、藕池河、吊線河。
荊門市地處漢江中下遊，水系發達，河湖眾多，溪流、泉水、水庫、運河，形成四大水系。
4.氣候
荊州屬亞熱帶季風氣候區。光能充足，熱量充足，無霜期長。全市年太陽總輻射104-110大卡/平方厘米，年日照時數1800-2000小時，年平均氣溫15.9-16.6℃，年無霜期242-263天。
荊門市地處中緯度北亞熱帶季風氣候區，雨量充沛，日照充足，無霜期長，具有春季溫暖濕潤，夏季炎熱，秋季幹爽，冬季寒冷的特點。年平均氣溫15.6-16.3℃，年平均降水量804-1067mm。
參考資料:
百度百科-荊門
百度百科-荊州
百度百科-湖北