這次重建使範靜形成了以金頂古茶堂、釋迦牟尼殿、彌勒殿為中心，沿潮汕大道向西延古寺、天馬古寺輻射的寺廟群。明朝萬歷二十七年(1599)，貴州亳州(今貴州遵義)土司楊應龍造反，害了範靜。“自播亂以來，謠言四起，來往香客甚少，卻又不繁華”(《贈碑》)。萬歷四十六年(1618)，範靜高僧妙宣邀明神宗重修範靜。“以舊日悼名山崩，贈高僧妙宣重修金頂正殿”(《贈碑》)。宗申下令重建範靜山，賜兩部佛經，並任命妙宣和尚主持範靜的重建工作。各級官員親自前往視察，京戶大夫李治延為重修範靜金頂(簡稱“賜碑”)作序。這次重修了五寺六殿:承恩殿、天慶殿、朝天殿、天麟殿、天池殿、九皇殿、三清殿、童淵殿、彌勒佛殿、釋迦牟尼殿、童鳴殿。其中，老金頂古茶堂被命名為黃安“皇殿”，又稱“金頂大雄寶殿”。廟內供奉皇帝牌位，賜“鎮山印”。天清寺、朝天寺、天林寺、天池寺被稱為“四大叢林”，也被封為範靜的“壹大殿四帝”。其他六殿位於正殿的承恩殿周圍，在世界上被稱為“六大覺寺”。此次加封的寺廟，大多有“天”或“恩”字樣，表示“明朝皇帝”的“威武禦恩”。妙宣和尚被尊為高僧，重開山野祖師。他的住持，金頂大雄寶殿承恩寺，主管全山朝拜，續傳梵燈。“禮物紀念碑”矗立在童鳴大廳旁邊，成為範靜山的“鎮山紀念碑”。
這次重建使範靜山形成了“壹大殿、四禦殿、六足殿、四古寺環山”的格局。各寺定寺產，招僧，修藏經閣。範靜因其對皇帝的仁慈而被命名為振宇，香火非常受歡迎。“自從開放以來，國內的信仰壹直在奔湧，且如雲，又如水。諸侯大人的尊稱，是隨著月亮不斷變化的。”“所謂古丁是新”(《贈碑》)。這壹時期，詩人張寫下了《登上尖巖，遙望山》，以“萬花千山”壹句贊美山；鄭宇的《登範靜》以“古堂燈燃長天，危樓鐘移暮”為題，旨在繁榮祭祀。清初，範靜成為反清人士避禪的僻靜之地。浙江詩人謝國庚，抗清失敗後隱居於此。他給自己取名為“天臺伊人”。(道光)《印江縣誌》載他:“愛山，居燕...印度人學的多，而且90多歲了。”
清康熙年間，山被重新封山重修，以“天”、“恩”為名的寺廟改為“國”、“恩”等名，以示“天朝”的仁慈與恩澤。黃安天池寺被命名為“護國寺”，成為範靜最大的寺廟。範靜佛教再度興盛，與西南佛教名山峨眉山、雞足山三足鼎立。天下爭奇鬥艷，遠至川蜀，湖廣江浙。每天早上，金頂大雄寶殿的承恩寺都擠滿了人，村民們在這裏賣食物、占蔔、藥材，就像趕集壹樣，所以承恩寺附近被稱為“老街”。(康熙)陳定《貴州遊記》雲:“範靜山(金頂)高數千米，古寺六座，春來香客千人。”(雍正)《新路觀音寺碑文》雲:“範靜山，尤知乾州妙景自我封。”嚴旭《範靜山》雲:“自明朝以來已有數百年，朝拜之聲不絕於耳...山上的每壹個清晨，香氣都是蒙蒙的，散落在整個下界...三縣拜者如蟻老，即鄰省西蜀、湖南亦絡繹不絕。”《金頂崖》載有康熙年間李光純與夫人陳壹同上山的十五年，以及“楚南條肯相貢，亦是其前任之故”等湖南人的詩句。乾隆年間，鄞江縣令、名劇《錯道上的花》《醜秋》(1769)作者李·(今屬河南)，城中大旱，觀滄海祈福滴水巖，雨立遍地，百姓設宴歡迎其勞動...像他們壹樣快樂”。
康乾年間，範靜不僅擴建了明代的“壹大殿四禦殿”，還在“四十八大足殿”中增加了“六大足殿”，主要有白雲寺、太平寺、鐘靈寺、八美寺、向輝寺、朝陽寺、香山寺、鎮江寺、東德寺、興隆寺、羅隱寺、羅江寺。其中，太平寺、八美寺、向輝寺和鐘靈寺是著名的。太平寺由清初思南府副將軍楊光潛和印江鄉賢楊創建。黃安太平寺、天慶寺毗鄰北朝山路，寺內占地900余平方米。名僧深信眾僧，尹田道沖(林佶33)先後主持，傳播了明末破山大師林佶派的法脈。八美寺，位於街南路潮汕大道，康熙十五年(1676)擴建。該寺還傳播了林佶教派的方法。因巴溪、梅溪兩條河谷有大量寺田，收成較多，在世界上被稱為“巴美寺粟”。此外，西路上的鐘靈寺和東路上的向輝寺也有很濃的香火。鹹豐五年(1855)，貴州爆發“鹹通起義”。銅仁紅軍領袖趙子龍，打出“上帝誕生，彌勒誕生”的口號，在範靜山三角村建立根據地，達到壹萬人，在思南朱靜園與“白軍”會師，多次進攻附近各縣。鹹豐帝下令川黔湘清軍“加痛殲滅”。同治九年(1870)，三角莊根據地淪陷，紅軍全軍覆沒。
光緒元年(1875)，太平天國余軍劉勝乘機上山，帶領二十余人冒充清軍，持槍入山，自稱“黑土地之王”，殺僧尼，四處劫掠。光緒五年(1880)，範靜山周圍五屬團練合編為《松濤會左營練軍》。新任貴州巡撫岑親自率軍督剿，在山高僧、銀江員廖、武術家的指導下，次年(181)消滅了劉勝。
經過紅軍和劉勝的鎮壓，範靜遭到嚴重破壞和摧殘。“寺院菩薩皆灰，我當和尚，風散雲流”(重修朝陽寺碑)。“山周圍的居民被這個搶了，殺了，不下700戶。為什麽墓葬殺死了4000多人？”(振國寺碑文)。為加強防範，巡撫岑號召在護國寺設立“都司衙門”，稱為“護國司”，並率領“松濤協廉軍”駐守八季環山，將山置於軍管之下，為期30年。廣東人吳越樓為鎮軍，“鎮守此山，號令嚴明，軍民不敢取”(《田宗潤詩集序》)。清政府將同仁縣遷至大江口，以控制同仁上官碼頭(後改為江口縣)。將思南州安化縣遷至大堡，鎮守西朝山大道(後改為德江縣)。“兩縣壹都司”的設立和調整，有效地防止了災害的再次發生，保證了範靜正常的祭祀活動。
從光緒六年(1881)開始，在嚴格的軍事管制下，岑於穎命和尚沈龍主持重建範靜。“所以重新籌款，還是建了。創建修復振國、水原、明珠等寺廟，修復香坪、明凈山等寺廟，開放老金頂，改造金頂、九皇洞。斯裏蘭卡的寺廟很輝煌，雕像也很明亮，尤其是比以前。他們相信好男人好女人，比去年更崇拜讀書人。”黃安的承恩寺已重修，院墻側門的碑文是壹副對聯:“煙平六年，香火萬人福。”寺內供奉雲貴總督岑於穎，作為“長生福祿”的牌位。光緒十壹年(1885)，全山再次開齋，眾僧推舉沈龍為方丈。沈龍是範靜最著名的僧人之壹。他主政範靜山30余年，直至民國初年。
光緒二十二年(1896)左右，範靜山第五次重建結束。此時，整座山面向番禺，佛像雄偉。在整座山的所有寺廟中，護國寺最為壯觀，首都衙門建在它旁邊，學校院子，武寺，賢寺和岑鞏寺補充。護國寺統領整座山，所有信徒的功德都在護國寺接受，在世界上被稱為“護國寺黃金”。護國寺旁的土地平坦寬敞，群峰環繞，世態炎涼，發展成村落。新建的寺廟尤其以水原寺廟聞名，該寺廟因在戰後接收無家可歸的婦女而被稱為“水原寺廟婦女”。這種重建已經超越了康乾盛世。(光緒)《銅仁地區誌》載拜範靜山盛況:“拜佛者拜名山，自稱進香，常結群，扶老攜幼...或數百人，或數十人為壹隊，引之以旗，各背黃符，哀叫唱佛歌，來回叫喚，瘋狂舉隊。”印江詩人田宗潤在《進山香客》中寫道:“為名利，許壹願，香客成群而行。步步應谷，南方無魚聲。”四川酉陽府劉華禮在金頂石壁上題對聯:“多奸夫毀於此；故無南無之事，生生不息。”
在此期間，行政長官吳月樓和觀眾席嘉賓朱中恒邀請學者參觀並舉辦大型詩歌會。《承恩寺碑》雲:“新出英雄，群賢畢至，夢遊被改寫於壁上，清風明月，各有誌，遂與嶽陽樓爭。”印江詩人田宗潤寫下《詩聚韻》，在範靜景區壹壹朗誦。其序曰:“六月盼之，邀學士學者，登暑假。從此，燕茶相吸，詩酒繁盛，鳳毛麟角。寶主已盡東南之美，信可樂。”鄞江著名書法家嚴(曾題寫“北京頤和園”匾額)在護國寺門口懸掛了“千山第壹山”的巨幅匾額。都司衙門正殿還有“千山教主”和“治赦”的巨型匾額，與墨寶名山相映成趣。衙門的士兵每天表演武術，勤勤懇懇地練習。鐵肩和尚，四川著名的武林高僧，去那裏學武，他流連忘返(後來到貴陽黔靈山鴻福寺，師從十方方丈明治，成為貴陽東山寺方丈，辛亥時期教貴陽革命黨新軍)。民國初年，貴陽壹名高僧與著名高僧陳、貴陽名人何麟書遊覽山。他們拜見了和尚龍燦，並寫了詩，流傳至今。