周琦火箭隊
2017年4月7日，周琦轉會新疆隊，開始征戰CBA聯賽。2016年6月24日，他在第二輪第43順位被休斯頓火箭隊選中。2017年4月7日，幫助新疆以總比分4-0擊敗廣東，獲得CBA聯賽2016-17賽季總冠軍，並獲得本賽季CBA年度最佳防守球員。7月8日，周琦正式與休斯頓火箭隊簽約，成為繼姚明之後第二位效力於休斯頓隊的中國球員。周琦被火箭裁掉了。2019年8月4日，周琦回到新疆。
新疆男籃周琦
本賽季，新疆男籃雖然實力大減，征戰全華班，但依然取得了8勝4負的成績，排名聯盟第六。其中，周琦的貢獻最大。場均上場33.8分鐘，得到23.8分13.7籃板2.7助攻1.2搶斷2.8蓋帽，投籃命中率51.5%。周琦對球隊的加分作用太大了。他受傷的時候，新疆男籃遭遇了三連敗，而當他回歸的時候，球隊立刻迎來了兩連勝。周琦最終因為他不做遊戲的態度和超強的實力得到了球迷的認可。在虎撲jrs評選中，周琦最終獲得CBA第壹階段最佳本土防守球員。
中國男子籃球隊周琦
隨著年齡的增長，周期逐漸趨於成熟。他知道自己的優勢和劣勢是什麽嗎？在這壹季中，它獲得了自身的分量，增加了對抗能力，實現了整個遊戲效果的質變，也增強了對遊戲走向的影響力。壹年級現在帶領新疆男籃這支青年軍在CBA大放異彩。