奇恒之腑的主要機能是：藏精氣。
奇恒之腑壹般來說指的是腦、髓、骨、脈、膽、女子胞六個器官。
大腦位於顱腔中，從上到顱脊，從下到風府，位於人體的最上部。風府以下，脊椎骨內的髓稱為脊髓。脊髓經項覆骨下的髓孔通向大腦，合稱為腦髓。腦和頭蓋骨合在壹起的東西叫做頭，頭是頭顱和頭髓的總稱。
膽，位於六腑第壹位，屬奇恒之府。膽與肝相連，附於肝短葉之間；肝和膽有經脈，互為表裏壹體。膽有金精水之氣，其色澤蒼翠。膽量足夠的人必然不容易被上帝嚇到。膽內主持的體元名為龍曜，字中包括明。慧觀下其在物元顯像化時，形如龜蛇混合體，以小童形態顯像時，穿九色錦衣，以綠色為主。
髓是骨腔中的糊狀物質，髓因人體分布部位不同，又有名稱差異。髓有骨髓、脊髓、腦髓之分。髓藏於壹般骨者為骨髓。隱匿於脊柱管內者為脊髓，脊髓經項後覆蓋骨下骨孔，通向大腦。
脈道既包括顯又包括隱，是陰陽***論，其中“道”既包括玄道，也包括通道、通道、隧道的含義。在經壹詞中，“經”是隱孢子蟲生理組織，“脈”是顯性物質源生理組織。修身學為了便於理論研究的分類，將“經脈”壹詞專門用於物質、原生理組織系統的經絡、八脈道、七丹線的訣竅，讀者要註意區別。
骨有貯藏骨髓和支持形體的作用。
女子胞也被稱為胞宮，即子宮，位於小腹部，在膀胱後呈倒梨形。婦女的子胞是月經和餵養胎兒的器官。慧觀下的子宮，其中的體素，掌管著子宮內的精、氣、血的功能。在元結構中，左右卵巢和子宮體都有元的氣脈通過陰溝之上。