1、發票是稅務機關核發的具有法律效力的證明收入或支出的憑證，可用於抵扣增值稅或申報所得稅；水單是自行開具的沒有法律效力的證明收入或支出的憑證，不能用於稅務抵扣或申報；
2、發票分為普通發票和專用發票，普通發票僅用於記賬，而專用發票可用於稅務抵扣；
3、水單僅用於臨時記錄交易情況，不能作為正式的會計憑證；
4、在交易中應盡量索取或開具發票，以便合法記賬和報稅；在無法獲取發票時，可使用水單暫時記錄，但需盡快補開或換取發票。
水單的使用場景：
1、水單作為銀行流水的證明：用於記錄個人或企業在銀行賬戶中的資金變動情況；
2、水單用於貸款審批過程：銀行或金融機構可能要求提供壹定時期內的銀行流水單以評估還款能力；
3、水單在會計核算中的作用：企業會計在進行日常賬務處理時，會使用水單來對賬和確認交易的真實性；
4、水單在稅務審計中的重要性：稅務機關在進行稅務審計時，可能會要求提供銀行流水單以核實收入和支出的真實性；
5、水單在法律訴訟中的證據價值：在涉及財務糾紛的法律訴訟中，水單可以作為資金往來的直接證據。
綜上所述，發票與水單的主要區別在於法律效力和稅務處理功能，發票是稅務機關核發的、具有法律效力的證明收支的憑證，分為普通和專用兩種，均可用於記賬，專用發票還可用於稅務抵扣；而水單僅作為臨時交易記錄，無法用於正式會計和稅務處理，因此在交易中應優先使用發票以確保合法記賬和稅務申報，水單則作為補充手段，需後續轉換為發票。
法律依據：
《中華人民***和國發票管理辦法實施細則》
第二十八條
單位和個人在開具發票時，必須做到按照號碼順序填開，填寫項目齊全，內容真實，字跡清楚，全部聯次壹次打印，內容完全壹致，並在發票聯和抵扣聯加蓋發票專用章。