壹、運輸方式不同
載體蛋白：載體蛋白參與的有主動運輸和協助擴散，在運輸過程中與相應的分子特異性結合，自身的構型會發生變化，並且會移動。
受體蛋白：受體蛋白參與的只是被動運輸，在運輸過程中並不與被運輸的分子或離子相結合，也不會移動，並且是從高濃度向低濃度運輸。
二、轉運速度不同
受體蛋白轉運速率與物質濃度成比例，且比載體蛋白介導的轉運速度更快。
三、特性不同
受體蛋白的結構和功能狀態在細胞內外理化因子作用下，能在數毫秒至數十毫秒的時間內迅速激活開放，隨後迅速失活或關閉，載體蛋白無此特性。
四、位置不同
載體蛋白：載體蛋白的位置在細胞膜的兩側。
受體蛋白：受體蛋白的位置在細胞膜的內部和表面。
五、作用不同
載體蛋白：載體蛋白的作用是在壹側與載體結合，然後在膜的另壹側把載體釋放。
受體蛋白：受體蛋白的作用是辨認和接收信號分子。
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