主要區別有，科目分類不同、形態特征不同、生活習性不同、分布範圍不同，具體如下：
壹、科目分類不同
1、梭子蟹
別稱海蟹、三疣梭子蟹，槍蟹，海螃蟹。屬十足目、梭子蟹科、梭子蟹種。
2、大閘蟹
中文學名中華絨螯蟹，別稱河蟹、毛蟹、清水蟹、大閘蟹、螃蟹。屬十足目、方蟹科、中華絨螯蟹種。
二、形態特征不同
1、梭子蟹
頭胸甲呈梭形，稍隆起。表面有3個顯著的疣狀隆起，1個在胃區，2個在心區。其體型似橢圓，兩端尖尖如織布梭，故有三疣梭子蟹之名。雄蟹腹部呈三角形，雌蟹呈圓形。雄蟹背面茶綠色，雌蟹紫色，腹面均為灰白色。
2、大閘蟹
頭胸甲呈圓方形，後半部寬於前半部。背面隆起，額及肝區凹陷，具有“青背、白肚、金爪、黃毛”的典型形態特征。
三、生活習性不同
1、梭子蟹
適應鹽度13~38‰，最適生長鹽度為20~35‰。越冬適應鹽度為28~35‰。白天潛伏海底，夜間出來覓食並有明顯的趨光性。屬於雜食性動物，喜歡攝食貝肉、鮮雜魚、小雜蝦等，也攝食水藻嫩芽，海生動物屍體以及腐爛的水生植物。
2、大閘蟹
中華絨螯蟹主要生活方式為底棲和穴居，壹般生活在石礫、水草叢中，常穴居江、河、湖蕩泥岸，晝匿夜出，以動物屍體或谷物為食。
四、分布範圍不同
1、梭子蟹
分布於日本、朝鮮、馬來群島、紅海以及中國大陸的絕大部分沿海。
2、大閘蟹
河蟹分布於中國，北自遼寧，南至福建沿海諸省通海河流中均有分布，尤其是長江中下遊兩岸湖泊、江河中都有它的蹤跡。?
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