銀行間債券市場與銀行間貨幣市場的主要區別如下：
1、形式不同
銀行間債券市場的形式是：依托於中國外匯交易中心，包括全國銀行間同業拆借中心（簡稱同業中心）和中央國債登記結算公司（簡稱中央結算公司）、銀行間市場清算所股份有限公司（上海清算所），以及商業銀行、農村信用聯社、保險公司、證券公司等金融機構進行債券買賣和回購；
銀行間貨幣市場的形式是：在壹年的期限內，由各銀行間進行金融資產交易。
2、作用不同
銀行間債券市場主要作用是：資金拆借，促進銀行間債券市場平穩健康發展，強化貨幣市場風險防控；
銀行間貨幣市場主要作用是：保持金融資產的流動性，以便隨時轉換成可以流通的貨幣。
3、交易方式不同
銀行間債券市場的交易方式：以詢價方式與自己選定的交易對手逐筆達成交易；
銀行間貨幣市場的交易方式：以定期存款單、商業票據，銀行承兌票據等方式進行流通交易。
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