“貝加爾湖”是英文“baykal”壹詞的音譯，俄語稱之為“baukaji”源出蒙古語，是由“saii”（富饒的）加“kyji”（湖泊）轉化而來，意為“富饒的湖泊”，因湖中盛產多種魚類而得名。貝加爾在鄂溫克語中稱為“la米u”，意思是“海”；蒙古語、布裏亞特語稱為“baigal dalai”，意為“自然海”；雅庫特語稱為“baikel”意為“豐富的湖”。人類學家認為現在的“baikal”從布裏亞特語而來。
貝加爾湖的寓意，《世界文化與自然遺產情景寫真地圖版》的解釋是“富饒的湖泊”；《彩圖版世界文化與自然遺產》則認為：當地的布裏亞特人稱之為“貝加爾—達拉伊”，意思是“天然之海”；而《世界奇景探勝錄》的文字卻是：“貝加爾”之名據說是大約1300年前住在這裏的庫裏堪人起的，意思是“大量的水”。