（壹）辦公室（黨委辦公室）
（二）政策法規處（研究室）
（三）幹部人事處
（四）規劃財務處（收費管理處）
（五）疾病預防控制與婦幼保健處
（六）衛生應急管理辦公室
（七）衛生監督處
（八）醫政管理處（基本藥物制度處）
（九）醫療服務監管處
（十）中醫藥服務監管處
（十壹）中醫藥傳承發展處（中醫藥綜合協調處）
（十二）基層衛生處（合作醫療管理處）
（十三）科研與教育處
（十四）新聞與宣傳處
（十五）國際醫學交流與合作處
（十六）健康促進處
（壹）辦公室（黨委辦公室）
（二）政策法規處（研究室）
（三）幹部人事處
（四）規劃財務處（收費管理處）
（五）疾病預防控制與婦幼保健處
（六）衛生應急管理辦公室
（七）衛生監督處
（八）醫政管理處（基本藥物制度處）
（九）醫療服務監管處
（十）中醫藥服務監管處
（十壹）中醫藥傳承發展處（中醫藥綜合協調處）
（十二）基層衛生處（合作醫療管理處）
（十三）科研與教育處
（十四）新聞與宣傳處
（十五）國際醫學交流與合作處
（十六）健康促進處