日本使領館向前往日本學習的自費留學生簽發的簽證有兩種：壹種是4-1-16簽證，壹種是4-1-16-3簽證。
壹、辦理4-1-16簽證程序
1、日本保證人將《入學通知書》和《在留資格認定書》寄給申請人，由申請人持上述證件向公安機關申請護照。
2、申請人取得護照後，具備下列材料就可向日本大使館申請留學簽證。
（1）留學理由書。詳細填寫去日本學習的目的和選修的學科，壹式兩份。
（2）個人履歷書。從小學填起，壹式兩份。
（3）誓約書。壹式兩份，式樣內容由日本使館提供，申請人照抄壹遍後簽名即可。
（4）填寫日本入境簽證申請表。壹式兩份。
（5）經公安機關出具的申請人與保證人關系的證明。
（6）申請人最後學校的畢業證書。
（7）錄取學校的入學通知書。
（8）身元保證書。須寫明保證申請人在日學習期間的旅費、學費和生活費，並保證申請者遵守日本法律並按期返國。壹式兩份。
（9）保證人的納稅證明書。
（10）申請人的護照和免冠近照5張。
3、將上述材料準備好後，送日本使館，日本使館便會受理申請。如果保證人已為申請人辦理了《在留資格認定證明書》並壹同送交大使館，便會立刻獲得留學簽證。否則需要等候3個月時間。
二、辦理4-1-16-3簽證程序
1、申請人通過保證人向擬前往的日本語言學校申請入學許可證。
2、由保證人持入學許可證，向入國管理局申請辦理"就學事前審查"手續。
3、入國管理局經審核，批準後就發給保證人壹份"就學生入國事前審查終了證"，再由保證人寄給申請人。
4、申請人持"就學生入國事前審查終了證"和其他手續向公安機關出入境管理部門申請辦理出國護照。
5、向日本駐華使領館索取"入境簽證申請表"、"親屬關系表"、"誓約書"。
6、填好使、領館提供的表格，並書寫壹份就學理由書、個人履歷書。
7、將以上證明材料壹並寄給日本駐華大使館或領事館辦理簽證，很快就可得到簽證。
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擴展資料：
日本留學簽證的審核重點
壹、家庭經濟支付能力
家庭經濟支付能力成審查重點留學申請者的家庭經濟支付能力更受重視。而經費支付人證明自身經濟能力的相關公***機關出具的各類證明被嚴格審查。
二、語言能力水平
以往申請赴日留學特別是讀語言類學校的申請者，在赴日前的日語水平通常要求只要具備150-200的日語學時數即可。但是由於近年來屢次出現申請者赴日前所出具的日語學時證明與實際日語能力不相符的情況，加之國內壹些語言培訓機構受利益驅使，虛開學時證明的現象頻發，失去了誠信度。鑒於上述情況，日本簽證審核加強了這方面的力度。
從近年的簽證整體情況分析，從下壹年度開始，除學時證明外，日本留學申請者將可能被明確要求提交日語水平測試機構出具的相應測試證明。除了日語能力水平測試(JPT)外，J.TEST考試(日本托業考試)將被更廣泛地采用。因為相對於日語水平能力測試(JPT)，該考試在考試時間上更利於學生選擇。
三、申請材料的真實性
日本簽證壹般分為兩部分：首先必須取得日本法務省入國管理局簽發的《在留資格認定證明書》(簡稱“在留”)，只有持有在留的申請者才有資格向各使領館提交最終簽證申請。按照慣例，由於日本入管局人手資金方面的局限性，在留審核階段，壹般主要以書面審核為主，多半不進行電話調查。對申請者本身或申請者經費支付人的相關調查壹般由各使領館進行。
但是，今年日本在第壹審核階段就加強了這方面的審核力度，壹些地域的入管局更是投入大量經費，雇傭大量翻譯從日本對申請者或經費支付人直接進行相關調查。所以，在此提醒留學申請者切勿抱有僥幸心理，提交與自身實際相符的申請材料是成功獲取簽證的保障。
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